หน่วยงานในสังกัด 5 หน่วยงาน ดังนี้
ศูนย์วิจัยและพัฒนาเมล็ดพันธุ์พืชพิษณุโลก
ศูนย์วิจัยและพัฒนาเมล็ดพันธุ์พืชเชียงใหม่
ศูนย์วิจัยและพัฒนาเมล็ดพันธุ์พืชขอนแก่น
ศูนย์วิจัยและพัฒนาเมล็ดพันธุ์พืชลพบุรี
ศูนย์วิจัยและพัฒนาเมล็ดพันธุ์พืชสุราษฏร์ธานี
