การสำรวจรวบรวมพรรณไม้น้ำ ได้ทั้งไม้น้ำที่วัชพืชทั่วไป ซึ่งมีทั้งพืชที่พืชท้องถิ่น และพืชต่างถิ่น และไม้น้ำที่พบในปริมาณและความถี่ต่ำมาก เช่น สันตะวาใบลอย (Ottelia ovalifolia) ผักพาย (Butomopsis latifolia (D.Don) Kunth) หรือพืชที่พบทั่วไป แต่มีความแตกต่างกัน เช่น สันตะวาใบพาย (Ottelia alismoides) แต่มีดอกสีม่วงอ่อน ขณะที่ที่พบทั่วไปมีสีขาว เป็นต้น ไม้น้ำต่างถิ่นที่ระบาดลงแหล่งและท้าให้พืชท้องถิ่นเดิมถูกรุกราน เช่น ธูปฤาษี ทำให้โพลง (Monochoria elata) หายไป นอกจากนี้ยังมีไม้น้ำประดับบางชนิดเริ่มระบาดลงแม่น้ำแม่กลองด้วย