เริ่มดำเนินการตั้งแต่ปี พ.ศ. 2532 เป็นต้นมา โดยการเก็บรวบรวมสายพันธุ์กาแฟจากแหล่งปลูกอื่นๆ ที่สำคัญ ซึ่งรวมถึงสายพันธุ์ 1/11 จากคุณรัตนา  อำเภอสวี จังหวัดชุมพร มาไว้ที่ ศูนย์วิจัยพืชสวนชุมพร เนื่องจากเกษตรกรนิยมปลูกแล้วเก็บเมล็ดพันธุ์มาขยายพันธุ์ต่อๆกัน จึงทำให้คุณภาพกาแฟมีความหลากหลาย และกาแฟโรบัสตาเป็นพืชผสมข้ามทำให้เมล็ดพันธุ์กาแฟที่ผลิตได้มี ผลผลิตต่ำ และมาตรฐานไม่ตรงตามที่ตลาดต้องการ ด้วยเหตุผลดังกล่าวจึงได้มีการร่วมมือกับหน่วยงานที่ดำเนินการเกี่ยวข้องทั้งภาครัฐและเอกชนทำการวิจัยด้านต่างๆ เพื่อแก้ปัญหาคุณภาพกาแฟให้ได้มาตรฐาน รวมถึงพันธุ์ปลูกซึ่งเป็นปัจจัยที่มีความสำคัญอันดับต้นๆเกี่ยวกับคุณภาพเมล็ด ศูนย์วิจัยพืชสวนชุมพรสามารถคัดเลือกพันธุ์กาแฟ ที่มีลักษณะดีและเมล็ดได้มาตรฐานตามที่ตลาดต้องการแล้วจำนวนหนึ่ง โดยในปี พ.ศ. 2536-2544 ได้ทำการคัดเลือกพันธุ์กาแฟได้ 3 สายพันธุ์ คือ สายพันธุ์ 1/11 1/13 และ 1/16 ทำการคัดเลือกและประเมินพันธุ์ตามขั้นตอนการปรับปรุงพันธุ์ ตั้งแต่ปี พ.ศ.2532-2548 รวมระยะเวลาการวิจัย 17 ปี