ศูนย์วิจัยพืชสวนจันทบุรีได้ดำเนินการค้นคว้าวิจัยพืชสวนเศรษฐกิจในภาคตะวันออก โดยมีงานวิจัยเกี่ยวกับไม้ผล (ทุเรียน เงาะ มังคุด พืชสกุลระกำ ลองกอง) และไม้ผลอื่นๆ ที่มีปลูกในภาคตะวันออก ไม้ดอกและไม้ประดับ (กล้วยไม้ เฟิร์น และไม้ดอกไม้ประดับพื้นเมือง) และ สมุนไพรและเครื่องเทศ (พริกไทย วานิลลา ขมิ้นชัน และอบเชย)  สรุปรวบรวมผลงานวิจัยที่สิ้นสุดแล้ว ดังนี้

งานวิจัยพัฒนาเทคโนโลยีการจัดการหลังการเก็บเกี่ยวเงาะผลสด

• การจัดการทำระบบ Cold-Chain โดยวิธี Pre-Cooling หลังเก็บเกี่ยวเพื่อชะลออาการ
  ขนเหี่ยวดำของเงาะ (หน้า ๔) 
• วิจัยและพัฒนาการเคลือบผิวเงาะด้วย palm oil เพื่อยืดอายุหลังการเก็บเกี่ยว (หน้า ๑๘)
• วิจัยและพัฒนาการเคลือบผิวจาก Carboxymethyl Cellulose (CMC) ในการยืดอายุผลเงาะหลังการเก็บเกี่ยว (หน้า ๓๐) สำ

งานวิจัยและพัฒนากล้วยไม้ 

• การสำรวจและรวบรวมกล้วยไม้ป่าในภาคตะวันออก  ศิริ
• การอนุรักษ์กล้วยไม้ป่าในภาคตะวันออกอย่างมีส่วนร่วม  ศิริ