ศูนย์วิจัยเกษตรวิศวกรรมชัยนาท จัดตั้งขึ้น เมื่อปี พ.ศ.2568 จากการปรับโครงสร้างภายในหน่วยงานของสถาบันวิจัยเกษตรวิศวกรรม โดยมีโครงสร้างเริ่มต้นคือ ผู้อำนวยการ, วิศวกร 2 ตำแหน่ง, ธุรการ 1 ตำแหน่ง นายช่าง 1 ตำแหน่ง และ พนักงานราชการ 1 ตำแหน่ง จัดตั้งในพื้นที่ของศูนย์วิจัยพืชไร่ชัยนาท 522 ตำบล บางหลวง อำเภอสรรพยา จังหวัดชัยนาท 17150
